La resistencia carga al capacitor, luego, el transistor NPN está conectado al revés, si vieras la estructura de un transistor el colector es el de mayor presencia, entonces al conectarlo al revés lo que obtienes es un pequeño sanwitch con una pequeña region N (emisor) otra más estrecha de P (base) y una enorme region N (colector), como no está conectada la base no está polarizada, y por el tamaño queda un diminuto y frágil diodo, cuando el voltaje sube (carga del capacitor) se supera el umbral que este pequeño diodo soporta, esto desplaza los electrones de la union P (base) a la N (emisor) y el diodo se vuelve conductor (efecto zener), una ves que eso se rompe, gracias a que la siguiente zona N (colector) es muy extensa conduce fácilmente y continua conduciendo, en condiciones normales esa gran zona N no permite para nada el paso de corriente pero a la inversa una ves que se supera el umbral de roptura se comporta básicamente como un diodo, en ese momento toda la carga del capacitor se escapa a travez del LED por el transistor, como el voltaje cae (descarga de capacitor) y la corriente de carga por la resistencia es muy pequeña, el transistor se recupera y vuelve a bloquear.
Bueno, es una idea vaga, realmente no recuerdo muy bien como se movían los electrones entre las regiones pero te da una idea de por que pasa eso, tiene que ver con la estructura interna del transistor mismo el como funciona, investiga eso por que puede que haya errado algunas cargas
, dibuja las regiones y los electrones para que veas como se llenan los huecos y sobrantes en las regiones dopadas.
Lo que no entiendo es por que no se apaga ya que si sacas el transistor queda aislado, así que ni debería encender, a menos que lo reemplaces por un puente, en ese caso brillará por que la corriente pasa directa.