Después de ver otros diagramas y comparar con los otros pares de resistencias, deduje que eran 10k y me da ese log que puede ser problema de booteo.
Si la resistencia es de 10 K entonces es de pullup, aunque no es común que el pin CLK la usé, es más común que esté en CMD.
No sé si es problema de la resistencia o el software no es el correcto pero es de ese mismo tipo de tarjeta.
Dudo que sea la resistencia, a menos de que hayas equivocado el lugar y quedó en serie entre la eMMC y el procesador.
Esto es fácil de saber porque una resistencia pullup (R91) va a positivo (VCC
Q), y pulldown a masa (R28).
También se puede comprobar la comunicación con un osciloscopio o una punta lógica.
Si falla la línea CLK, no se obtendrán datos en <DAT0 : DAT7>
La comunicación entre la eMMC y el procesador ocurre por un breve periodo, cuando la tarjeta se conecta a la red eléctrica y constantemente cuando se da la orden de encendido.
La imagen anterior es solo referencia del SoC MT5659, no significa que esta conexión sea general en todas las tarjetas.
Edit: Encontré un diagrama correspondiente al RTD2968
La conexión de resistencias viene así:
Pullups = 10 KΩ, Data Bus = 10Ω