La prueba que yo haría es : desconectar provisionalmente (previa foto o anotación para poder restaurarlo adecuadamente) y alimentar el primario del transformador directamente con los 220Vac a través de un fusible o térmica de digamos 6 a 10 A. durante un minuto con una taza de agua adentro . . . ¿a ver que hace?
Nota : el microondas debe estás desenchufado para ésta prueba , se enchufará solamente durante un minuto el cable que alimente al transformador.
EDITO : También la puerta deberá estar perfectamente cerrada para hacer ésta prueba.