Con flip-flop no creo que puedas, ya que la frecuencia no es base 2 y como unn flip-flop divide por 2 la frecuencia no podes obtener 1Hz. Es decir:
[LATEX]N_{flip-flop}=\frac{\log(50.10^{6})}{\log(2)}=25,57[/LATEX]
Por eso necesitaste 26 flip-flop y por eso no te da 1Hz justo.
Una alternativa (encima más practica que 26 f-f), es usar 6 contadores módulo 10 y un contador módulo 5.
Los módulos 10 los podés conseguir como BCD natural y el módulo 5 lo podés hacer vos con un par de compuertas.