Cómo que no? El capacitor de entrada (que posee la placa de sonido) bloquea sólo DC, osea frecuencia 0. Una señal AC cuadrada, trenes de pulsos, la salida astable de un 555 y demás es perfectamente medible. De hecho, la señal de calibración que posee la placa es cuadrada.
Kal00, en tu caso, al medir la tensión de salida de las fuentes, sólo vas a ver la componente AC correspondiente al rizado, la contínua se bloquea.
Saludos
No es perfectamente cuadrada, asique cuando lo calibren no piensen que es una onda cuadrada. Les va a ahorrar un par de dolores de cabeza