Pruebo la configuración con totem pole y les cuento.
Por qué no probás un par de snubbers en el primario en lugar de intentar mejorar la conmutación de los mosfets?
En la DC-DC trabajan a 75[Khz] sin tener que mejorar el apagado y lo hacen sin calentar.
PD: acabo de ver la foto, protoboards y alta frecuencia + potencia son viejos enemigos; yo no me guiaría tanto por los resultados que obtenés ahí en cuanto a calentamientos y demás. Un buen ruteado es muy importante en estas fuentes.
Saludos