Creo que confundes fundamentos. Si monitoreas tensión, pues la corriente la limita la impedancia de entrada del DAQ.Una última cosa, añadiendo estos transformadores y regulando el nivel de voltaje al que necesito......es necesario una protección adicional a la DAQ? como por ejemplo a las corrientes que podrían circular?
Lo que debes implementar es un limitador de nivel, pero no puedes usar un zener, porque presenta una curva cerca de la tensión de zener, distorsionando la señal en la zona de mayor amplitud. Lo que obliga a usar un zener de mayor tensión, para lo cuál la seguridad se desvirtúa.
En lo personal cuándo he necesitado un limitador de umbral, utilizo un op-amp de colector abierto, conectando en su entrada (+) el nivel de tensión de referencia a limitar.
Por la entrada (-) la señal a limitar y dicha salida se conecta a la entrada (-). Ahora no tengo cómo subir un esquema para ser más claro.