Para ir descartando problemas, por que no levantas los cables del magnetron, entre la carcasa y cualquiera de los dos terminales no debe tener continuidad y entre los dos terminales 1 o 2 ohms (casi en corto), si hasta ahi vas bien medi el diodo en lo posible con un tester analogico, si hasta ahiii vas bien, levanta el primario del trafo lo probas encendiendolo, si venimos bien contectas de nuevo el primario y levanta el secundario y volves a probar, si no salta el fusible, levantas los cables del magnetron Y CON MUCHISIMO CUIDADO LO PROBAS sin el magnetron (con el diodo y el capacitor conectados eh)
Ni se te ocurra medir la tension del secundario del trafo, ni nada de eso, asi descartas si es el magnetron, el diodo o el capacitor o inclusive el trafo, y de ahi partir para no andar tirando manotasos a lo ciego.
Saludos