Hola Pablitox, voy a intentar responder tus preguntas.
Con respecto a la primera, ¿a cuáles transistores exactamente te refieres?, porque podemos dividir en dos grupos los transistores de esta fuente: los que están en configuración Darlington y dan la potencia de salida (en tu esquema Q1, Q2, Q3 y Q6), y los que controlan el nivel de voltaje y corriente de salida (Q4 y Q5 respectivamente).
En cuanto al primer grupo, la idea es que para Q6 y Q3 la resistencia de base sea Q2 (en tu esquema dichos transistores tienen sendas resistencias de 100 Ohmios, no sé en cuál esquema de este hilo te habrás basado). A su vez la resistencia de base de Q2 es Q1 y este tiene por resistencia de base a R1 (10k). No hay que olvidar que un transistor se puede entender como una resistencia cuyo valor se controla por la corriente de base (Transistor = Transfer-Resistor).
En cuanto al segundo grupo (Q4 y Q5), los divisores de voltaje a los que están conectados dan la resistencia a sus respectivas bases. Considerando además que para cuando los potenciómetros (VR1 y VR3) llegan al extremo en que podrían permitir una muy alta corriente de base, esta misma corriente activaría al transistor y este derivaría a masa la corriente de base del primer grupo de transistores (corriente de base de Q1 y por ende de Q2 y Q3-Q6) causando la caída en la salida de la fuente del nivel de voltaje, que al fin de cuentas es de donde dichos Potenciómetros toman la corriente, por lo que tanto Q4 como Q5 se auto protegen de sobrecorrientes (siempre y cuando el resto del circuito esté correcto).
Con respecto a las resistencias Base-Emisor y en especial a la referida de 47 Ohmios, hasta donde entiendo cumplen una función de afinación para el transistor que no es visible a simple vista (sobre todo si la carga de la fuente es digamos una simple lámpara de filamento), pero si observáramos en un osciloscopio la señal de salida, seguramente veríamos una señal más llana (menos ruido) si incluimos dichas resistencias. Tal vez tenga que ver el hecho que en los amplificadores de audio las bases de los transistores no llevan solo una resistencia sino que van a un divisor de voltaje (dándole al transistor una ganancia no tan dependiente de su Beta, la cual es muy variable); También entiendo que en el transistor en las uniones de sus capas semiconductoras, se crean unas pequeñas capacitancias que provocan oscilaciones en el dispositivo y que una resistencia de valor bajo entre Base y Emisor sirve de ruta de descarga evitando dichas oscilaciones. Además si esta resistencia se quema es porque mínimo el o los 2n3055 están en corto y cambiándola por una de valor más alto nos ahorraríamos unos centavos pero el verdadero problema es ¿por qué se están deñando los transistores de potencia?.
Esto es lo que puedo decir hasta donde entiendo (o creo entender), espero sirva de algo. Un saludo.