Yo generalmente pongo siempre los componentes, todos, en el esquema, y me limito a copiar y pegar las pistas, para luego ir recolocando los componentes.
Esto es más una cuestión de filosofía, y en mi caso, de 'higiene mental', pues así siempre tengo todos los componentes localizables en el esquema.
Aún así, se que el Protel permite hacer un esquema de un bloque, y luego ir repitiendo el esquema como si fuesen bloques, y el mismo se encarga de renombrar los componentes, etc, pero no se como hacerlo, ni me interesa de momento, pues las dimensiones de mis proyectos son reducidas (de una a 5 páginas de esquema).